参与形成核仁时的染色质区，核仁从核仁组织区部位产生，同时与该区紧密相连。具有核仁组织区的染色体称核仁染色体。核仁组织区定位在核仁染色体次缢痕部位。对人来说，在13、14、15、21、22对染色体上存在核仁组织区。核仁形成后常发生融合现象，所以虽存在多对染色体，但常见间期细胞中仅有1～2个核仁，如人二倍体间期细胞中含一个大的核仁，它包含有从5对核仁染色体上核仁组织区来的DNA袢环，这些袢环上含有核糖体核糖核酸（rRNA）的基因。