引起肠道感染的各种细菌（如志贺菌、弯曲菌及沙门菌）、病毒（甲型肝炎病毒）及寄生虫（如贾第虫、阿米巴）也可通过性传播，尤其是用口接触生殖器、肛门的性活动。临床表现为各种不同微生物感染肠道所致的相应症状，可有腹泻、发热、腹胀、恶心、呕吐、腰痛及黄疸。感染复发频繁，尤其有多个性伴侣的男性同性恋者。有时感染不引起症状。