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医学遗传学/遗传病的基因诊断举例
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{{Hierarchy header}} === 1.[[基因]]缺失型[[遗传]]的诊断=== (1)α地贫的[[基因诊断]]:α地贫主要是由于基因缺失引起的,缺失的基因可以由1-4个。正常[[基因组]]用BamHⅠ切割,可以得到一个kb的片段,而缺失一个α基因时切点向5’端移位,得到一条10kb的片段。因此,当用α[[基因探针]]与基因组[[DNA]]进行Southern杂交时(图13-8),在α地贫<sub>2</sub>可见一条14kb和一条10kb的带,在正常人可见一条双份的14kb的带,而在α地贫<sub>1</sub>则见一条单拷贝的14kb带,[[血红蛋白]]H病时只有一条10kb的带的,而在Barts[[水肿]]胎时,则无任何杂交带。 {{图片|gv21dkgc.gif|α地贫基因缺失的诊断}} 图13-8 α地贫基因缺失的诊断 左图:16号[[染色体]]上携有数目不同的基因 右图:α基因探针杂交的结果 箭头:BamHⅠ切点 一种较简便的方法是直接用α[[探针]]进行[[斑点杂交]],自显影后根据斑点深浅的不同也可以对α地贫作出诊断。更为简单的方法是PCR诊断,即在α基因缺失范围内设计一对[[引物]],然后PCR[[扩增]][[胎儿]]的DNA,如为Barts 水肿胎,则无扩增产物,电泳后无任何带纹,从而可建议进行[[人工流产]],但此法不能诊断其它类型的地贫(除非另设计引物用作PCR)。 (2)DMD/BMD的缺失型诊断:DMD/BMD是一种Ⅹ[[连锁隐性]]遗传的[[神经]]肌肉系统受累的致死性[[遗传病]](参阅第四章)。DMD/BMD有70%左右为缺失型。此基因很大,缺失可发生在不同部位,因此应尽可能采用多对引物作PCR扩增(多重PCR)来检测。如扩增产物电泳后发现有带纹的缺失,即可作出诊断并对缺失定位(图13-9),在进行[[产前诊断]]时,一般可先通过检测家系中有关成员,即确定[[先证者]]的缺失区,然后有针对性地作PCR扩增,包括缺失部分的两端,以判断胎儿或有关患儿是否也获得了相同的基因缺失,但非缺失型不能用此法查出。 === 2.[[点突变]]型遗传病的基因诊断2=== (1)镰形[[细胞]]性[[贫血]]的基因诊断:已知[[突变基因]]是编码β[[珠蛋白]]链的第6位[[密码子]]由GAG变为GTG,从而使[[缬氨酸]]取代了[[甘氨酸]],因此可用如下方法进行诊断。 {{图片|gv21dkgc.gif|DMD基因缺失的多重PCR诊断}} 图13-9 DMD基因缺失的多重PCR诊断 exon:[[外显子]];pm:[[启动子]];1:正常9条带;2:基因全缺失;3:启动子区缺失;4:第3外显了缺失;5:第13外显子缺失;6:第47外显子缺失;7:47-52外显子区段缺失;8:第52外显子缺失 1)RFLP诊断:已知[[限制酶]]MstⅡ切割的识别顺序是CCTNAGG,它能切割正常β链中CCTGAGG序列,但不能切割[[突变]]了的CCTGTGG(A→T)。这样,由于突变消除了一个切点,使[[内切酶]]长度片段发生了改变,通过电泳,就可以区别正常的β<sup>A</sup>和β<sup>S</sup>(图13-10)。 {{图片|gv21dkgc.gif|镰状贫血的基因诊断}} 图13-10 镰状贫血的基因诊断 除MstⅡ外,限制酶DdeⅠ(识别序列为CTNAG)也能够把正常的β<sup>A</sup>基因与镰变了的β<sup>S</sup>[[基因区]]别开来,并用于诊断。 2)[[ASO]]探针诊断:由于突变部位和性质已完全明了,也可以合成[[寡核苷酸探针]],用<sup>32</sup>P标化来进行诊断。此时需要合成两种探针,一种与正常β<sup>A</sup>基因序列完全一致,能与之稳定地杂交;另一种与突变基因序列一致,能与β<sup>S</sup>基因稳定杂交,但不能与正常的β<sup>A</sup>基因杂交。根据杂交结果,就可以把发生了突变的β<sup>S</sup>[[基因检测]]出来。 PCR技术问世以来,ASO诊断又有新的改进,即先PCR扩增长约110bp的基因片段,然后再与ASO探针杂交。这样可减少目的基因DNA用量,并降低与基因组DNA杂交时的非特异性信号。 === 3.基因异常不明的遗传病的诊断=== [[成年型多囊肾]]病(adult polycystic kidney disease,APKD)是一种[[常染色体]][[显性]]遗传病,[[发病率]]高,约1000人中有1名致病基因的[[携带者]],起病较晚,多在30岁以后,主要为肾和肝中出现多发性[[囊肿]],[[临床表现]]为[[腰疼]]、[[蛋白尿]]、[[血尿]]、[[高血压]]、[[肾盂肾炎]]、[[肾结石]]等,最终可导致[[肾功能衰竭]]和[[尿毒症]]。本病[[基因定位]]在16p13,与α珠蛋白基因3’端相邻,但致病基因尚未克隆,[[基因产物]]的[[生化]]性质和[[疾病]]发病机理也尚未阐明。因此,目前只能用[[连锁分析]]来进行基因的发病前诊断和产前诊断。由于通过家系分析,已证实APKD的致病基因与α珠蛋白基因3’端附近的一段小卫星DNA序列即3’HVR(3’ hypervariable region)紧密连锁,而后者在人群中具有高度[[多态性]],因此可以通过RFLP连锁分析进行诊断(图13-11)。 {{图片|gv21dkgc.gif|成年型多囊肾病的连锁分析诊断}} 图13-11 成年型多囊肾病的连锁分析诊断 从图13-11可见,当用3’HVR作为探针与PvuⅡ酶切后的家系有关成员基因组DNA杂交时,可见有5.7、3.4和2.4kb的3种[[等位片段]]。患者的母亲有5.7和3.4kb两种片段,父亲为2.4kb[[纯合子]],其子女凡有3.4片段者为患者,而凡无此片段者都不是患者。因此可知致病基因伴随3.4kb等位片段分离,即与之相连锁。图中Ⅱ<sub>5</sub>的DNA检查只有5.7和2.4kb而无3.4kb片段,故不是患者或致病基因携带者。 {{Hierarchy footer}} {{医学遗传学基础图书专题}}
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